FACTURA RECTIFICATIVA POR IVA REPERCUTIDO INCORRECTAMENTE.

    Aplicar un tipo de IVA equivocado, repercutir una cuota superior a la que correspondía o, por el contrario, no repercutir IVA cuando la operación debía llevarlo son errores que van bastante más allá de una simple incorrección formal en la factura.En estos casos no solo tenemos un documento que corregir: hemos repercutido incorrectamente el impuesto y además de modificar la factura emitida habremos de regularizar esta situación frente a la Administración tributaria.

    En este sentido, el artículo 15.2 del Reglamento de Facturación -RF-, aprobado por el RD 1619/2012, señala:



    Así, nos encontramos ante una causa específica y autónoma de factura rectificativa, distinta de la prevista en el artículo 15.1 para las facturas que incumplen alguno de los requisitos obligatorios de los artículos 6 y 7. En determinados supuestos pueden coincidir ambas circunstancias, pero cuando el problema está en la propia cuota de IVA, el artículo 15.2 ofrece el fundamento específico de la rectificación.

    La conexión con la Ley 37/1992, del Impuesto sobre el Valor Añadido -IVA- la encontramos en su artículo 89, que obliga al sujeto pasivo a rectificar las cuotas repercutidas cuando hayan sido determinadas incorrectamente.

Cuota determinada incorrectamente.

    Hemos de identificar estas situaciones con cuando el IVA que figura "o debería figurar" en la factura no es el que legalmente correspondía a la operación en el momento de su devengo.

    Pueden darse, entre otros, casos como:

1. Aplicamos un 21 % cuando correspondía un 10 %.


2. Aplicamos un 10 % cuando correspondía un 21 %.


3. Repercutimos IVA en una operación que debía estar exenta.


4. No repercutimos IVA porque consideramos equivocadamente que la operación estaba exenta.


5. Tratamos incorrectamente una operación como sujeta a inversión del sujeto pasivo.


6. Calculamos mal aritméticamente la cuota correspondiente a una base y un tipo correctos.


7. Etc.

    Tal vez con un ejemplo podamos ubicar en mejor medida el motivo de este tipo de rectificación:

¿Cuándo aplicar la rectificación?

    El artículo 89.Uno LIVA establece que la rectificación debe efectuarse cuando advirtamos la causa de la incorrecta determinación, siempre que no hayan transcurrido cuatro años desde el devengo de la operación.

    El Reglamento de Facturación sigue la misma lógica, es decir, la factura rectificativa debe expedirse tan pronto como tengamos conocimiento de la circunstancia que obliga a rectificar y dentro del plazo legal correspondiente. Además el apartado Dos de este mismo artículo 89, permite rectificar incluso cuando no se repercutió cuota alguna, siempre que se hubiese expedido la factura correspondiente a la operación (una factura que se creía exenta de IVA y no lo estaba).

IVA correcto de la factura: Mayor o menor que el facturado.

    Esta pregunta es de vital importancia pues, de acuerdo con el artículo 89.5 de la LIVA, no se regulariza igual; este apartado establece procedimientos distintos según la rectificación aumente o disminuya las cuotas inicialmente repercutidas, pues tengamos en cuenta que si la factura original ya había sido declarada, también tenemos que regularizar el IVA ante Hacienda. Así distingamos:

    A. Rectificación que AUMENTA las cuotas inicialmente repercutidas.

    El artículo 89.Cinco de la LIVA establece que, cuando la rectificación aumenta las cuotas inicialmente repercutidas y no ha mediado requerimiento previo, debe presentarse la correspondiente declaración-liquidación rectificativa, aplicándose los recargos e intereses de demora que procedan conforme a la LGT. Para períodos iguales o posteriores a septiembre de 2024 en liquidación mensual o tercer trimestre de 2024 en liquidación trimestral, la AEAT utiliza con carácter general el propio modelo 303 como autoliquidación rectificativa, indicando el justificante de la autoliquidación anterior. Luego:



    La regularización puede generar los correspondientes recargos e intereses conforme a los artículos 26 y 27 Ley 58/2003, General Tributaria -LGT-.

    B. Rectificación que DISMINUYE las cuotas inicialmente repercutidas.

    Situaciones en las que inicialmente se ha repercutido más IVA del debido. En este caso, el artículo 89.Cinco permite elegir entre dos vías:

1. Rectificar la autoliquidación originaria. Puede instarse la rectificación de la autoliquidación en la que se declaró aquella cuota excesiva. Esta posibilidad es confirmada expresamente por el TEAC en Resolución 06764/2023, de 24 de marzo de 2026, que además declara un cambio de criterio respecto de su doctrina anterior.
   
   Entiende este Tribunal que puede rectificarse la autoliquidación originaria dentro del plazo general de prescripción de cuatro años.
   
   
   Reseñar que actualmente existe aquí una especialidad procedimental muy importante con el sistema actual de autoliquidaciones rectificativas: la propia AEAT advierte que no puede utilizarse la autoliquidación rectificativa ordinaria del modelo 303 cuando el motivo sea haber repercutido IVA por importe superior al debido y ello implique además rectificar la factura. En ese supuesto debe acudirse al procedimiento correspondiente de rectificación.



2. Regularizar en un Modelo 303 posterior. El artículo 89.Cinco.b) permite también regularizar en la declaración correspondiente al período en que deba efectuarse la rectificación o en las posteriores, dentro del plazo legal. En este caso existe una condición esencial: se debe reintegrar al destinatario la cuota de IVA repercutida en exceso.
   
   La Resolución comentada del TEAC de 24 de marzo de 2026 confirma esta segunda vía y concreta que la cuota rectificada puede incluirse en la autoliquidación del período en que se emite la factura rectificativa o en las siguientes dentro del plazo de un año desde la emisión de ésta.

Cómo reflejar la rectificación en los Modelos de IVA.

    Como hemos hecho en otros apartados de este informe, aquí conviene separar las distintas situaciones que pueden acontecer:

1. Todavía no hemos presentado el Modelo 303.
   Descubierto el error, se emite la factura rectificativa y como todavía no se ha presentado la autoliquidación correspondiente, se declara la operación de forma que el resultado fiscal sea el correcto. No debe "rectificarse un modelo 303 anterior" porque todavía no existe.



2. Ya se ha presentado el Modelo 303.
   La Regla general nos dice que se ha de rectificar la autoliquidación del período original. En períodos sometidos al sistema actual se utilizará, con carácter general, el Modelo 303 como autoliquidación rectificativa del período afectado.

    Cuando exista obligación de presentar el Modelo 390, éste deberá ser coherente con las regularizaciones practicadas durante el ejercicio.

Recomendación.

Comentarios

La factura rectificativa: Motivos para su emisión, plazos, etc.

Formularios

Modelos de Facturas Rectificativas.
Instrucciones para la cumplimentación del Modelo 303 de la AEAT.
Instrucciones para la cumplimentación del Modelo 347 de la AEAT.
Instrucciones para la cumplimentación del Modelo 390 de la AEAT.

Jurisprudencia y Doctrina

Resolución 06764/2023 TEAC. Vías para recuperar IVA repercutido en exceso en periodos previos
Consulta Vinculante V0305-24. Fecha y regularización del IVA por emisión de facturas rectificativas.

Legislación

Art. 6 RD 1619/2012 RF. Contenido de la factura.
Art. 7 RD 1619/2012 RF. Contendio de las facturas simplificadas.
Art. 15 RD 1619/2012 RF. Facturas rectificativas.
Art. 80 Ley 37/1992 LIVA. Modificación de la base imponible.
Art. 89 Ley 37/1992 LIVA. Rectificación de las cuotas impositivas repercutidas